3730xl基因分析仪
基本情况：
设备名称 | 基因测序仪 |
型号 | 3730xl |
国别和厂家 | 美国Thermo公司(原ABI公司) |
启用日期 | 2012年09月 |
主要功能与用途 | 96道毛细管模式，用于核酸测序与片断分析 |
主要技术指标 | 激光：氩离子激光光源，激发波长为488nm和514.5nm 电泳电压：高达20kV 运行温度：18℃到70℃ |
仪器现状 | 良好 |
联系人 | 李士林 |
联系方式 | 51630602 |
通讯地址 | 淞沪路2005号复旦大学江湾校区生科大厦 |
安置地点 | 生科大厦A601-1室 |
3730xl基因分析仪简介
3730xl基因分析仪特点：
AppliedBiosystems推出的3730xl基因分析仪系列，代表了进行高通量、高质量测序和片段分析的新一代平台，3730xl基因分析仪整合了自动化装置和光学技术的最新进展，同样应用AppliedBiosystems优化的试剂和专门的软件系统，可以完全满足实验者日益增加的通量需求和质量需求。
3730xl基因分析仪系统的技术特点：
•双光束双侧激光激发，后置超薄CCD
•全自动上样系统
•内置条形码阅读器
•自动碱基识别与质量评分软件
•POP-7液体分离胶
•良好的温控装置提供了更大的温控范围（18~70℃）
3730xl基因分析仪用于DNA测序的主要优点：
•电泳温度可达70℃，有助于去除二级结构的影响
•良好温控装置保证片段分析准确性及重现性好
•分离胶(POP~7TMPolymer)使通常读序长度即可达800-1000bp
•新型碱基识别与质量评分软件，提高测序准确性
•毛细管内荧光检测，灵敏度高
•双光束双侧激光激发，荧光信号强度高度均一
•高灵敏度提高了测序模板DNA的浓度范围
2015年共享情况：
校内共享：
张锋老师课题组 10机时
李辉老师课题组10机时
胡薇老师课题组40机时
卢大儒老师课题组 40机时
王笑峰老师课题组40机时
王久存老师课题组40机时
王红艳老师课题组10机时
李士林老师课题给25机时
校外共享：
暂无校外共享
Miseq测序仪
基本情况：
设备名称 | Miseq测序仪 |
型号 | Miseq |
国别和厂家 | Illumina公司 |
启用日期 | 2015年09月 |
主要功能与用途 | 微生物多样性分析、宏基因组测序、转录组denovo测序、微生物基因组测序、小RNA测序、表达谱、ChIP-Seq |
主要技术指标 | 1、一轮测序反应生成的有效数据量最高可达15Gb（即150亿个碱基）； 2、一轮测序反应生成的可读测序片段序列最高可达2500万条； 3、一轮测序反应（最高完成15Gb数据量）的所用的全部试剂和耗材成本不高于2000美元；一轮测序反应的过程包括样本文库克隆扩增、测序和数据分析； 4、单端读取序列的有效数据读长可达300个碱基；双端读取序列的有效数据读长可达2×300个碱基。 5、测序质量标准为Q30（即每个碱基的准确度为99.9％），并且75%以上的碱基比例达到Q30； 6、 样本文库克隆扩增原理为桥式PCR法； 7、 每100碱基测序的碱基缺失率<0.001； 8、具备多重SNP分析功能，可在一轮实验中同时检测384个样品，对384×1536＝589824个SNP的DNA片段进行测序比对分析； 9、可精确读取≥12个的连续单个重复碱基（如AAAAAAAAAAAAAAAA）； 10、具备云储存功能，并具有公共交流平台，方便与业内专家共同分析与合作。 11、测序系统主机内置服务器，主机同时具备样本文库克隆扩增、测序和数据分析功能；无需再配置额外的样本文库克隆扩增和分析服务器； 12、仪器同时具备并免费提供以下软件分析功能：全基因组重测序、定向重测序、De novo 测序、序列特异DNA结合蛋白的ChIP-Seq、组蛋白修饰和表观遗传标记的ChIP-Seq、16s宏基因组学研究、mRNA测序、基于标签的基因表达、小RNA测序、降解DNA样品的测序、末端配对mRNA测序、DNA印迹和等位基因特异的表达、CNV-Seq：用测序测定拷贝数变异研究 |
仪器现状 | 良好 |
联系人 | 李士林 |
联系方式 | 51630602 |
通讯地址 | 淞沪路2005号复旦大学江湾校区生科大厦 |
安置地点 | 生科大厦A601-1室 |
Miseq测序仪简介
Miseq是Illumina推出的个体化二代测序仪，
快速得到准确可靠性数据，它能让研究人员在7个小时内从起始样本得到分析好到数据，且具有革命性到流程和无可比拟到准确性。
Miseq 是唯一一台在单台仪器上整合了扩增、测序和数据分析到新一代测序仪，每次运行能产生多达7Gb到数据，
能快速且经济高效到遗传分析到理想平台，适合广泛到应用。
2015年共享情况：
暂无共享信息，仪器调试期。