个人信息 

职称：特聘教授

电话：021-31246746 

邮箱：xushua@fudan.edu.cn

地址：复旦大学生命科学学院C611室

工作经历

徐书华，无党派人士；2006年博士毕业于复旦大学，同年入职中科院-马普学会计算生物学伙伴研究所，历任助理研究员、副研究员、研究员；2009年建立群体基因组学研究组（PGG）；2012-2018年担任德国马普学会和中科院共同支持的青年科学家小组组长；2013年兼任上海科技大学特聘教授；2015年任中科院特聘研究员（核心骨干）、获国家杰出青年基金；2016年入选上海市优秀学术带头人；2018年兼任中科院动物进化与遗传前沿交叉卓越创新中心特聘研究员、入选科技部中青年科技创新领军人才；2019年获英国皇家学会牛顿高级访问学者基金资助；2021年7月入职复旦大学任特聘教授，建立人类群体组学实验室（POG）。兼任中国遗传学会理事、上海市遗传学会常务理事、上海市人类学会理事；兼任多个SCI学术期刊编委如Molecular Genetics and Genomics共同主编、Scientific Reports、Human Genomics、Hereditas、BMC Genomic Data资深编辑（Senior Editor）。

研究方向

群体组学、人类遗传、分子进化、生物信息学、计算生物学。

获奖情况

Journal of Genetics and Genomics 2020年度优秀编委奖（2020）

英国皇家学会—牛顿高级访问学者（剑桥大学）（2019-2022）

遗传与发育协同创新中心2019年度“十大科技进展”（2020）

2019年度中国生物信息学十大进展（2020）

2019年度中国生物信息学十大数据库（2020）

入选科技部中青年科技创新领军人才（2018）

中科院院长奖（导师）（2018）

教育部自然科学一等奖（第5完成人）（2018）

入选上海市优秀学术带头人计划（2016）

入选“中国科学院特聘研究员” -- 特聘核心骨干（2015）

中国科学院青年创新促进会（首届）“优秀会员”（2015）

国家杰出青年科学基金 （2015）

国家自然科学二等奖（第2完成人）（2015）

中国科学院上海分院“青年五四奖章”（2015）

上海市遗传学会杰出贡献奖（2015）

中国科学院青年创新促进会2012-2013年度“优秀会员”（2013）

中科院青年科学家奖（2012）

中科院上海生科院-美国礼来公司优秀毕业论文导师奖（2012）

中科院上海分院第三届杰出青年科技人才奖（2012）

教育部自然科学奖（一等）（第2完成人）（2012）

上海市科技启明星（2011）

全国百篇优秀博士学位论文（2011）

入选首届中国科学院青年创新促进会（2011）

复旦大学优秀博士学位论文（2010）

上海市优秀博士学位论文（2009）

法国赛诺菲-安万特-上海生科院青年人才奖（2009）

日本明治乳业生命科学奖（2009）

中国科学院卢嘉锡青年人才奖（2009）

代表论文

Xixian Ma#, Wenjun Yang#, Yang Gao, Yuwen Pan, Yan Lu, Hao Chen, Dongsheng Lu, Shuhua Xu*. Genetic origins and sex-biased admixture of the Huis. Molecular Biology and Evolution. 2021. Doi:10.1093/molbev/msab158.

Lian Deng and Shuhua Xu*. Population Genomics of High-Altitude Adaptation (Book Chapter in Evolution of the Human Genome II, Book edited by Dr. Saitou, University of Tokyo, Japan), Springer, (ISBN 978-4-431-56902-2). 2021, Page: 67-100.

Xinjun Zhang , Kelsey E Witt , Mayra M Bañuelos , Amy Ko , Kai Yuan , Shuhua Xu, Rasmus Nielsen, Emilia Huerta-Sanchez*. The history and evolution of the Denisovan-EPAS1 haplotype in Tibetans. PNAS. 2021, 118(22): e2020803118.

Lan-Tao Gou, Yang Gao, Jun-Yan Kang, Xin Wang, Hao Chen, Min-Min Hua, Zheng Li, Dangsheng Li, Xiang-Dong Fu, Hui-Juan Shi*, Shuhua Xu* and Mo-Fang Liu*. Reply to Lack of evidence for a role of PIWIL1 variants in human male infertility. Cell. 2020. 184(8):1943-1944.

Hao Chen#, Yan Lu#, Dongsheng Lu & Shuhua Xu*. Y-LineageTracker: a high-throughput analysis framework for Y-chromosomal next-generation sequencing data. BMC Bioinformatics. 2021. 22:114.

Ziqing Pan and Shuhua Xu*. Population genomics of East Asian ethnic groups. Hereditas. 2020. 157:49.

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Lian Deng#, Chao Zhang#, Kai Yuan#, Yang Gao#, Yuwen Pan, Xueling Ge, Yaoxi He, Yuan Yuan, Yan Lu, Xiaoxi Zhang, Hao Chen, Haiyi Lou, Xiaoji Wang, Dongsheng Lu, Jiaojiao Liu, Lei Tian, Qidi Feng, Asifullah Khan, Yajun Yang, Zi-Bing Jin, Jian Yang, Fan Lu, Jia Qu, Longli Kang, Bing Su, Shuhua Xu*. Prioritizing natural selection signals from the deep-sequencing genomic data suggests multi-variant adaptation in Tibetan highlanders. National Science Review. 2019, 6(6):1201–1222.

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Lei Tian, Asifullah Khan, Zhilin Ning, Kai Yuan, Chao Zhang, Haiyi Lou, Yuan Yuan, Shuhua Xu*. Genome-wide comparison of allele-specific gene expression between African and European populations. Human Molecular Genetics. 2018, 27(6):1067-1077.

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Qidi Feng#, Yan Lu#, Xumin Ni#, Kai Yuan#, Yajun Yang#, Xiong Yang, Chang Liu, Haiyi Lou, Zhilin Ning, Yuchen Wang, Dongsheng Lu, Chao Zhang, Ying Zhou, Meng Shi, Lei Tian, Xiaoji Wang, Xi Zhang, Jing Li, Asifullah Khan, Yaqun Guan, Kun Tang*, Sijia Wang*, Shuhua Xu*. Genetic history of Xinjiang’s Uyghurs suggests Bronze Age multiple-way contacts in Eurasia. Molecular Biology and Evolution.2017, 34:2572-2582.

Dongsheng Lu, Haiyi Lou, Kai Yuan, Xiaoji Wang, Yuchen Wang, Chao Zhang, Yan Lu, Xiong Yang, Lian Deng, Ying Zhou, Qidi Feng, Ya Hu, Qiliang Ding, Yajun Yang, Shilin Li, Li Jin, Yaqun Guan, Bing Su, Longli Kang, and Shuhua Xu*. Ancestral Origins and Genetic History of Tibetan Highlanders. American Journal of Human Genetics.2016,99:580-594.

Haiyi Lou, Yan Lu, Dongsheng Lu, Ruiqing Fu, Xiaoji Wang, Qidi Feng, Sijie Wu, Yajun Yang, Shilin Li, Longli Kang, Yaqun Guan, Boon-Peng Hoh, Yeun-Jun Chung, Li Jin, Bing Su, Shuhua Xu*.A 3.4-kb Copy-Number Deletion nearEPAS1Is Significantly Enriched in High-Altitude Tibetans but Absent from the Denisovan Sequence.American Journal of Human Genetics.2015, 97(1):54-66.

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Shuhua Xu*, Wenfei Jin. Population Genetics in the Genomic Era (Book Chapter in Population Genetics, Book edited by Dr. Stuart Raleigh, University of Northampton, UK), InTech, Rijeka, Croatia (ISBN 979-953-307-446-6). 2012, Page: 137-168.

Wenfei Jin, Pengfei Qin, Haiyi Lou, Li Jin*, Shuhua Xu*. A Systematic Characterization of Genes Underlying both Complex and Mendelian Diseases. Human Molecular Genetics.2012,21(7):1611-1624.

Shuhua Xu*. Human Population Admixture in Asia. Genomics & Informatics. 2012, 10(2):133-144.

Shuhua Xu*, Shilin Li, Yajun Yang, Jingze Tan, Haiyi Lou, Wenfei Jin, Ling Yang, Xuedong Pan, Jiucun Wang, Yiping Shen, Bailin Wu, Hongyan Wang, Li Jin*. A Genome-Wide Search for Signals of High Altitude Adaptation in Tibetans. Molecular Biology and Evolution. 2011, 28:1003-1011.

Shuhua Xu*, Sanchit Guputa and Li Jin*. PEAS V1.0: A Package for Elementary Analysis of SNP Data. Molecular Ecology Resources. 2010, 10:1085-1088.

The HUGO Pan-Asian SNP Consortium (Li Jin*, Edison T. Liu*, Mark Seielstad*, Shuhua Xu*; 93 authors from 10 countries).Mapping Genetic Diversity in Asia. Science.2009, 326:1541-1545.