2025年5月16日，Journal of Genetics and Genomics在线发表复旦大学王传超教授团队题为“ADGAP: a user-friendly online Ancient DNA Database and Genome Analysis Platform”的研究论文。该研究设计开发了一个集古DNA数据管理、分析，以及结果可视化于一体的在线数据库和在线数据分析平台ADGAP (https://adgap.online/home)，支持数据检索、群体遗传分析和结果可视化功能，并免费提供Web服务。
ADGAP整合了Allen Ancient DNA Resource (AADR v60)数据库，为研究者提供以下核心功能：1. 群体遗传分析工具箱：集成了全面的群体遗传学分析工具，包括PCA、ADMIXTURE分析、f3/f4统计、qpWave分析和qpAdm建模，输出内容包含计算结果和可视化图表；2. 时空动态数据可视化：支持查询SNPs的基本信息及其在群体中等位基因频率，结果以包含时间信息交互式地图的形式，进行可视化展示；3. 数据便捷浏览与检索：基于AADR数据库个体元数据，构建交互式大规模数据表格，支持古DNA资源的便捷浏览与筛选；4. 助力探索性分析：提供动态的在线图表生成功能，便于用户进行探索性数据分析；5. 智能问答助手加持：平台利用大语言模型和检索增强生成技术，开发网站问答助手，显著提升用户的使用体验。
ADGAP在线基因组分析功能概述
综上所述，古DNA数据分析平台ADGAP界面友好，研究人员能够便捷地浏览古DNA资源并通过简单操作完成群体遗传学分析，绕过了对高级计算技能的需求，为推动古DNA研究的普及以及促进群体遗传学与考古学的交叉研究提供重要支持。
厦门大学人工智能研究院硕士研究生陈彦伟和厦门大学生命科学学院博士研究生徐煜为该论文共同第一作者，王传超教授为通讯作者，厦门大学朱孔阳博士(现为维也纳大学博士后)对本文做出重要贡献。该工作得到国家杰出青年基金、国家重点研发计划、国家社科基金重大项目和国家自然科学基金面上项目等资助。