设备名称 | 基因测序仪 |
型号 | 3130xl |
国别和厂家 | 美国ABI |
启用日期 | 2005年 |
主要功能与用途 | 16道毛细管模式，用于核酸测序与片断分析 |
主要技术指标 | 激光：氩离子激光光源，激发波长为488nm和514.5nm 电泳电压：高达20kV 运行温度：18℃到65℃ |
仪器现状 | 良好 |
联系人 | 李士林 |
联系方式 | 51630602 |
通讯地址 | 淞沪路2005号复旦大学江湾校区生科大厦 |
安置地点 | 生科大厦A601-1室 |
主要性能特点：
• 3130xl 采用 16 道毛细管
• 24 小时无人监控操作
• 仪器设置更方便更简单
• 新型自动灌胶系统进行灌胶
• 检测池加热器改进了温度控制
• 通过 96 孔自动进样
• 3130 POP-7™分离胶
• 多色荧光检测
• 一种分离胶一种毛细管用于多种应用
应用范围：
- 用于碱基识别的序列分析软件
- 用于微卫星、SNP、AFLP 和 LOH 分析的 GeneMapper®/GeneMapper® ID 软件
- 用于比较测序、突变检测，以及杂合子插入和剔除
软件：
美国应用生物系统公司的 3130 和 3130xl 基因分析仪包括用于数据收集和自动分析样品文件的软件。它采用Windows XP® 软件平台，样品文件使用 Sequencing Analysis Software v5.2和 GeneMapper Software进行分析。
设备名称 | 基因测序仪 |
型号 | Ion torrent |
国别和厂家 | 美国ABI |
启用日期 | 2013年 |
主要功能与用途 | 半导体基因组测序 |
主要技术指标 | 将化学信号转换为数字信号 |
仪器现状 | 良好 |
联系人 | 李士林 |
联系方式 | 51630602 |
通讯地址 | 淞沪路2005号复旦大学江湾校区生科大厦 |
安置地点 | 生科大厦A601-1室 |
简介
Ion Torrent是最新一代的测序技术，它的核心技术是使用半导体技术在化学和数字信息之间建立直接的联系。在半导体芯片的微孔中的微球上固定DNA链，随后依次掺入ACGT。随着每个碱基的掺入，释放出氢离子，在它们穿过每个孔底部时能被检测到，通过对H+ 的检测，实时判读碱基。
Ion Torrent由于硬件设备无需光学检测和扫描系统，并且使用天然核苷酸和聚合酶、无需焦磷酸酶化学级联，无需标记荧光染料和化学发光的配套试剂，因此测序成本低，其应用范围涵盖Sanger方法和已有高通量测序技术的应用，如基因组DNA序列测定（微生物基因组测序、线粒体测序、靶向测序）、DNA扩增子测序等。
技术特点
1、简单：基于半导体技术测序原理，不用荧光、化学发光和酶级联反应；消耗样本少；
2、快速：从文库构建到数据产出只需2天，上机测序只需2～3小时；
3、灵活性：可满足不同通量的测序需求。
314 TMChip（~10Mb/run），316 TMChip（~100Mb/run），318 TMChip（~1Gb/run）
4、准确性：99.97%
应用范围
1、小基因组测序（如：微生物和病毒的从头测序和重测序；线粒体测序等）
2、扩增子重测序（如：16S宏基因组测序）
3、靶向重测序
4、转录组/全外显子测序